backend/frontend/runtime: 训练面板 / session 隔离 / agent runtime 调整

- backend/api/server.py：训练 step-detail / pipeline 卡片排序逻辑
- frontend：thread-list / thread / training-pipeline-panel / step-detail-sheet 配套调整，新增 metrics-chart-panel
- src/agent_*：tool spec / runtime / prompting 配套
- .gitignore 加 .logs/

Co-Authored-By: Claude Opus 4.7 <noreply@anthropic.com>

src/agent_tool_specs/execution.py

@@ -10,51 +10,6 @@ def build_execution_tools(handlers: Mapping[str, ToolHandler]) -> list[AgentTool
     """构建本地命令、Python 执行与短等待工具声明。"""
 
     return [
-        AgentTool(
-            name='python_exec',
-            description=(
-                '优先用本工具执行小型 Python 代码或项目内 Python 脚本，用于结构化文件分析、'
-                'JSON/JSONL 处理、批量校验、数据抽样和快速计算。默认使用当前用户独立 Python venv；'
-                '不要用 bash 运行 python/python3/.venv/bin/python。不要用本工具安装依赖。'
-                '缺包时应向用户确认后再处理依赖。一次性分析优先传 code；项目或 skill 内已有脚本优先传 script_path，'
-                '不要在 code 里用 subprocess 二次调用 Python 脚本。如需写临时文件，'
-                '必须写入环境变量 PYTHON_EXEC_SCRATCHPAD 指向的会话隔离目录，'
-                '不要在项目根目录创建临时 .py 脚本。'
-            ),
-            parameters={
-                'type': 'object',
-                'properties': {
-                    'code': {
-                        'type': 'string',
-                        'description': '要通过 python -c 执行的 Python 代码。code 和 script_path 必须二选一；一次性分析优先使用 code。',
-                    },
-                    'script_path': {
-                        'type': 'string',
-                        'description': '工作区内已有、需要长期复用的 Python 脚本路径。code 和 script_path 必须二选一；不要为一次性分析在项目根目录新建脚本。',
-                    },
-                    'args': {
-                        'type': 'array',
-                        'items': {'type': 'string'},
-                        'description': '传给脚本的命令行参数。仅在 script_path 模式下使用。',
-                    },
-                    'stdin': {
-                        'type': 'string',
-                        'description': '可选标准输入内容。',
-                    },
-                    'timeout_seconds': {
-                        'type': 'number',
-                        'minimum': 1,
-                        'description': '可选超时时间，默认 30 秒。读大 CSV/JSONL、pandas 分析、批量校验、训练评测脚本等可能 >30s 的任务必须显式传值（常规 120-300、训练/长跑 600+）。',
-                    },
-                    'max_output_chars': {
-                        'type': 'integer',
-                        'minimum': 100,
-                        'description': '可选输出截断长度，默认使用当前会话输出限制。',
-                    },
-                },
-            },
-            handler=resolve_handler(handlers, 'python_exec', 'execution'),
-        ),
         AgentTool(
             name='python_package',
             description=(
@@ -94,10 +49,13 @@ def build_execution_tools(handlers: Mapping[str, ToolHandler]) -> list[AgentTool
         AgentTool(
             name='bash',
             description=(
-                '运行真实 shell 命令，例如系统命令、进程控制、git 只读检查或用户已确认的依赖安装。'
-                '不要用 bash 执行 python、python3、pip 或 .venv/bin/python；结构化文件分析、'
-                'JSON/JSONL 处理、批量校验、数据抽样和快速计算必须优先使用 python_exec。'
-                'Python 包安装必须优先使用 python_package。'
+                '运行真实 shell 命令，包括系统命令、进程控制、git 只读检查、用户已确认的依赖安装，'
+                '以及所有 Python 脚本执行。'
+                '执行 Python 时，把代码先写到 scratchpad 下的 .py 文件，'
+                '再用本工具跑 `python3 -u <script> 2>&1 | tee <log>`；'
+                '`-u` 关掉 stdout 缓冲，`tee` 让进度行实时落盘，超时被 kill 时仍能 `tail` 日志看到死在哪个 phase。'
+                '不要把多行 Python 代码以 `-c` 字符串方式塞进 command。'
+                'Python 包安装必须优先使用 python_package；不要通过 bash 执行 pip。'
                 '需要等待远端长任务（>30s 的训练、文件落盘、外部 API 回调）时，'
                 '设置 run_in_background=true 让命令在后台 detach 跑、立刻返回 task_id；'
                 '默认 wait_for_completion=true 时进程结束后会自动起新一轮把结果送回。'