Add directory-based project skills

docs/task-001-directory-skills.md

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+# Task 001：目录化 Skills
+
+## 目标
+
+把 skill 内容从 Python 内置字符串迁移到文件目录中，让 data-agent 工作流可以用文件形式开发、review 和维护。
+
+## 范围
+
+- 保持当前 `Skill` 工具和 agent loop 不变。
+- 支持从 `src/skills/bundled/*/SKILL.md` 加载内置目录化 skill。
+- 保持 Python 动态 skill 可用。
+- 使用已有内置 skill 作为迁移样例。
+
+## 第一批切片
+
+- `simplify` 和 `debug` 继续保留 Python 实现，因为它们需要读取动态运行时数据。
+- `verify` 和 `update-config` 迁移到目录化 skill。
+- `SKILL.md` 支持简单 front matter：
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+```text
+---
+name: verify
+description: Verify a code change works by running the app and tests.
+when_to_use: When the user asks to verify, test, or check that recent changes work.
+allowed_tools: read_file, bash, grep_search, glob_search
+---
+
+Skill prompt body...
+```
+
+## 成功标准
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+- `/skills` 仍然能列出迁移后的 skills。
+- Web UI `/api/skills` 仍然能返回迁移后的 skills。
+- `Skill({"skill": "verify"})` 返回 `SKILL.md` 中的 prompt 正文。
+- 现有 Python 动态 skills 仍然可用。
+
+## 当前状态
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+- 目录化 skill loader 已在 `src/bundled_skills.py` 实现。
+- `verify` 已迁移到 `src/skills/bundled/verify/SKILL.md`。
+- `update-config` 已迁移到 `src/skills/bundled/update-config/SKILL.md`。
+- 动态 skills `simplify` 和 `debug` 继续保持 Python 实现。